Po předchozí sezóně skončil u Vajgaru trenér Jiří Veber, který se přesunul k mládeži do pražské Slavie. Na jeho místo měl původně od začátku sezóny nastoupit staronový kouč František Joun, ale vše bylo trochu jinak. Kormidla A-týmu Vajgaru se chopil Jan Kamír, kterého později vystřídal zmíněný Joun. Toho na konci listopadu doplnil Miloslav Čech, který u rybníku Vajgaru působil až do konce ročníku 2010/2011.
Nelichotivé výsledky nepřinesla už příprava na mistrovskou sezónu. Vajgar pouze jednou vyhrál nad Pelhřimovem a remízoval s Velkým Meziříčím. Studenou sprchou bylo hned první kolo, kdy Vajgar dostal před domácím publikem nelichotivou desítku od ambiciózních Benátek nad Jizerou. Na první body si musel Vajgar počkat až do šestého kola, kdy na domácím ledě porazil Velké Meziříčí vysoko 7:0. Dalo se očekávat, že se výsledky Vajgaru zlepší, ale proher bylo víc než výher. Vajgar dokázal bodovat v Táboře nebo v Písku, ale zbytečně ztrácel body s Nymburkem, Pelhřimovem nebo s nováčkem z Kutné Hory, se kterým si Vajgar poměrně pravidelně půjčoval poslední příčku tabulky.
Po odehrání 22 kol základní části byl Vajgar s jednobodovou ztrátou právě na Horu na posledním místě. V lednu začala prolínací soutěž se skupinou Západ. Sudé týmy obou skupiny hrály každý s každým, stejně tak týmy z lichých příček tabulky. Vajgar tak bojoval s Kutnou Horou na dálku. Jihočeši před důležitou částí sezóny posilili. Ze severu Čech přišel produktivní Petr Freiberg, z francouzského angažmá pak útočník Kamil Šťastný.
Do druhé části sezóny Vajgar sice vstoupil porážkou v Rokycanech, na Kobře Praha Vajgar vybojoval bod za prohru v prodloužení a další zápas zavedl Vajgar do Mělníka. U soutoku Labe s Vltavou hosté dvakrát vedli, ale v nervozním utkání Vajgar nakonec prohrál 3:6. Pak Vajgar přetlačil v domácím prostředí Klatovy a zaskočil favorita na jeho ledě, když remízoval v Klášterci nad Ohří 2:2. Po druhé prohře s Rokycany následovaly čtyři zápasy, které Vajgaru přinesly rovných deset bodů a defacto i záchranu ve třetí nejvyšší soutěži v ČR. Vajgar doma porazil Kobru 4:2, otevřel si střelnici v Litoměřicích (8:2) a oplatil porážku Mělníku (6:1). Z předposledního zápasu potřeboval Vajgar k jistotě záchrany alespoň bod. Jihočeši ve městě karafiátů vedli dvakrát o jeden gól. Hosty poslal do vedení Roman Šulčík. Domácí vyrovnali, ale hradecký kapitán Jiří Cmunt přidal druhý gól. Klatovy sice srovnaly stav, ale remíza po 60 minutách znamenala udržení druholigové příslušnosti pro jindřichohradecký tým, narozdíl od Kutné Hory, která se po roce vrátila do krajského přeboru. Sezóna 2007/2008 patřila k nejméně povedeným sezónám v novodobé historii jindřichohradeckého hokeje.
Pořadí Klub Z V VP R PP P Skóre Body 1. HC Benátky nad Jizerou 22 17 1 0 0 4 109:44 53 2. HC Chrudim 22 16 1 2 0 3 101:48 52 3. IHC KOMTERM Písek 22 13 0 2 0 7 67:49 41 4. HC ZVVZ Milevsko 22 12 0 0 1 9 82:65 37 5. Spartak Pelhřimov 22 10 0 3 2 7 82:71 35 6. HC Tábor 22 9 2 2 0 9 72:68 33 7. TJ SC Kolín 22 9 0 2 1 10 67:84 30 8. HHK Velké Meziříčí 22 9 0 1 0 12 65:99 28 9. NED Hockey Nymburk 22 8 0 0 0 14 56:82 24 10. HC VHS Benešov 22 7 0 1 1 13 66:83 23 11. TJ Stadion Kutná Hora 22 5 1 0 0 16 57:90 17 12. KLH Vajgar Jindřichův Hradec 22 4 1 1 1 15 51:92 16
Pořadí Klub Z V VP R PP P Skóre Body 1. HC Benátky nad Jizerou 34 28 1 0 0 5 182:65 86 2. HC Chrudim 34 25 3 2 0 4 160:63 83 3. IHC KOMTERM Písek 34 22 1 3 0 8 125:74 71 4. HC ZVVZ Milevsko 34 21 1 0 2 10 130:89 67 5. HC Tábor 34 16 5 2 0 11 130:96 60 6. Spartak Pelhřimov 34 18 0 3 2 11 154:121 59 7. NED Hockey Nymburk 34 15 1 0 0 18 97:111 47 8. HHK Velké Meziříčí 34 14 0 3 0 17 104:137 45 9. HC VHS Benešov 34 13 0 2 1 18 111:128 42 10. TJ SC Kolín 34 12 0 2 3 17 109:143 41 11. KLH Vajgar Jindřichův Hradec 34 9 1 3 2 19 96:131 34 12. TJ Stadion Kutná Hora 34 10 1 1 0 22 100:135 33
Po odchodu brankáře Tomáše Štůraly řešil Vajgar post prvního brankáře. Nejprve své štěstí u Vajgaru zkoušel jihlavský Petr Kotlík, ale neuspěl. Na jeho místo se posunul junior Lukáš Melišík. Branku Vajgaru hájil také dorostenec Daniel Krásný a novojičínský René Urbánek. Vedení klubu se v průběhu sezóny podařilo angažovat brankáře brněnské Komety, Tomáše Kubeše, jehož hostování se v průběhu sezóny změnilo v přestup. Tomáš Kubeš pak měrou vrchovatou přispěl k záchraně druhé ligy v Jindřichově Hradci.
Nejproduktivnějším zadákem Vajgaru byl v této sezóně Josef Vachulka (5+9), jemuž na záda dýchali Ondřejové Cikán a Chmel. V průběhu ročníku se k týmu Vajgaru připojili Michal Klíma, Martin Všetečka nebo David Balík. Tři zápasy v Hradci odehrál i finský zadák Jussi Kuikka.
V ročníku 2007/2008 se v dresu Vajgaru představilo hned 22 forvardů. Kapitán Jiří Cmunt nasbíral 30 kanadských bodů za 15 branek a stejný počet asistencí. Pravidelně bodovali Michal Ištvánik, Karel Ton a Kamil Šťastný, který se u Vajgaru objevil až po Novém roce. V 11 zápasech nasbíral 17 kanadských bodů a výrazně přispěl k udržení ve druhé lize.
Neslané výsledky sebou přinesly i slabší návštěvnost. V první části sezóny byla průměrná návštěva na hradeckém stadionu necelá pětistovka. Ve druhé části to bylo lepší. Vajgar pravidelně bodoval a zájem o hokej byl vyšší. V nadstavbové části byl návštěvnický průměr 790 diváků na utkání, což bylo suverénně nejvyší číslo ve skupinách Střed a Západ.
Junioři Vajgaru se po ročním účinkování v Extralize vrátili do druhé nejvyšší soutěže. V lize juniorů podávali hradečtí nevýrazné výkony a v konečném součtu obsadili osmou příčku. Na stejném místě zakončili sezónu i hradečtí dorostenci.
